El 23/11/2011, en Salta, y con la dirección técnica de Ramón Díaz, el Rojo jugó por primera vez este campeonato desde su reinstalación en el fútbol argentino. Aquella vez Independiente goleó 4-0 a Colegiales.

Al cabo de 12 participaciones, la mejor ubicación fueron los Cuartos de Final. Instancia a la cual accedió en 3 ocasiones sin resultados positivos. En 2019, Lanús lo superó por 2-0 en Newells en un partido signado por la polémica en un tanto de Sand. En 2022 en Chaco, Talleres por penales dejó fuera de camino al Diablo. Y finalmente en 2024 en Lanús, en otro partido con dejos de injusticia en el resultado, Vélez ganó por 1-0.

Independiente disputó 11 veces la fase de 32 avos y siempre se llevó el cheque o el pasaporte que estaba en juego. Fueron 8 victorias en los 90 minutos (4-0 Colegiales, 4-2 Santamarina, 2-1 San Telmo, 8-0 Central Ballester, 4-0 Atlas, 1-0 Villa Mitre, 3-0 Ciudad Bolívar y 3-0 Laferrere) y después hubo que sufrir 3 definiciones por penales (1-1 con Alianza Coronel Moldes, 0-0 con Camioneros y 1-1 con Central Norte).

Con respecto al rival, el historial se reduce a dos partidos de la Temporada 2013/2014. En Córdoba, el Rojo ganó por 1-0 con un cabezazo de Parra, tras una excelente combinación ofensiva y una sociedad triangular con el Rolfi Montenegro y Pizzini. En la vuelta, en Avellaneda, Independiente ganó 3-2 un partido bastante complejo. Tula abrió el marcador tras una serie de rebotes en el área chica. Sp. Belgrano lo empató con una jugada de pelota parada de corner que aprovechó Medina. Antes que termine el primer tiempo Vidal adelantó al Rojo con un remate de larga distancia. En el complemento Martorell puso otra vez la igualdad con un cabezazo de una nueva pelota parada. A menos de un cuarto de hora para el final, Penco cayó en el área y Maglio sancionó penal. El Ruso Rodríguez lo convirtió por gol ante el reclamo masivo de los visitantes incluyendo al técnico Ramacciotti.